福建省教育科学研究所成立于1982年3月，是福建省教育厅直属的全额拨款事业单位，内设办公室、高等教育研究室、职业教育与终身教育研究室、基础教育研究室、教育政策与法规研究室、教育发展研究室、教育史志研究室、《教育评论》编辑部8个科室，主办《教育评论》《福建教育研究》等学术刊物。福建省教育科学规划领导小组办公室设在福建省教育科学研究所。

省教科所职责主要有：负责教育系统人员教育理论培训事务性工作；编辑、出版、发行教育理论书刊；提供教育科研信息资料。具体为：（1）贯彻落实省委教育工委和省教育厅工作部署，参与全省性教育发展战略、政策法规和其他重要文件的调研、起草和论证工作；（2）组织参与教育研究信息的综合工作；（3）管理全省教育科学规划课题；（4）研究我省基础教育、职业与成人教育、高等教育面临的现实教育问题；（5）建立完善省、市、县、学校四级教育科研支撑体系，组织开展和指导教育教学改革实验，推广教育教学改革和科研成果，开展教育科研的学术合作与交流；（6）办好《教育评论》《福建教育研究》等学术刊物；（7）组织福建教育史志的编撰工作。